Make your own free website on Tripod.com

 

 

 


Part 2: Linkage Analysis


 

 

The marker data shown below provides chromosome 6 genotypes for the AD family members.  The markers listed are known as microsatellites, which are highly polymorphic markers.  The alleles each correspond to different sizes of repetitive sequences at a specific location. 

Maker Data:

ID# D6S263 D6S259 D6S285 D6S105 D6S1051 D6S1017 D6S271 D6S1280 D6S254 D6S251
1 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0
2 1 10 13 10 1  4 6  7 5  4 5  3 10  9 2  2 6  6 5  5
3 11  1 10 13 9  1 5  7 3  4 5  3 11  9 8  2 6  6 1  5
4 7  8 13 14 1  1 6  7 5  6 7  7 8 10 5  2 6  6 6  2
5 11 10 10 10 9  4 5  7 3  4 5  3 11  9 2  2 6  6 7  5
6 3 10 10 10 9  4 5  7 3  4 5  3 11 10 2  2 6  6 7  5
7 11 10 10 10 9  4 5  6 3  5 5  5 11  9 2  2 6  6 7  5
8 3 10 10 13 9  1 6  6 5  5 5  5 9 10 8  2 6  6 1  5
9 11  1 15 13 1  1 6  6 5  5 5  5 9 10 8  2 6  6 1  5
10 11 10 10 10 9  4 5  7 3  4 5  3 11  9 2  2 6  6 7  5
11 1  7 13 13 1  1 7  6 4  5 3  7 9  8 8  5 6  6 1  6
12 1  7 13 13 1  1 5  7 3  5 5  7 11  8 8  5 6  6 5  6
                   
ID# D6S300 D6S1021 D6S474 D6S1040 D6S1003 D6S1007 D6S305 D6S264 D6S503 D6S1027
1 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0
2 5  8 7  5 6  3 5  2 8  5 1  2 3  4 5  6 5  8 10  6
3 8  8 5  5 8  3 3  2 5  5 2  3 1  4 1  6 7  8 8  6
4 8  8 2  8 8  5 5  2 5  6 0  0 5  6 2  2 8  5 7  2
5 7  5 7  7 8  6 8  5 5  8 2  3 2  4 0  0 7  5 8 10
6 8  5 5  7 8  6 3  2 5  5 1  3 2  3 1  5 5  8 8  6
7 7  8 7  5 8  3 8  2 5  5 2  3 1  4 1  6 5  8 8  6
8 8  5 5  7 8  6 3  5 5  5 1  3 1  3 1  5 5  8 8  6
9 8  8 5  7 8  6 3  5 5  8 1  3 2  3 0  0 7  5 8 10
10 8  8 5  5 8  3 3  2 5  5 2  3 2  4 1  6 5  8 8  6
11 8  8 5  2 8  8 3  5 5  5 1  2 4  5 2  6 8  8 6  7
12 8  8 5  8 8  5 3  5 5  5 0  0 4  6 2  6 7  5 8  2

Click Here to open a new window to see what the entire pedigree file for the AD family would look like.

Click on the computer below to analyze these files in this AD family.